窑街煤电集团的物流产业主要由铁路运输公司和金能科源公司部分业务板块构成。铁路运输公司于1960年6月29日建成通车，1967年成立窑街火车站，管理28.5公里的铁路专用线，1976年11月升格为窑街矿务局铁路运输处，2008年8月改制为窑街煤电集团铁路运输公司。2015年6月，集团公司通过整合关联业务板块，将原甘肃金能工贸有限公司物流公司部分业务整合移交铁路运输公司管理。